Üniversitemizin bulunduğu mevkide Burdur Belediyesi'ne ait kanalizasyon hattı bulunmadığından, üniversitemiz oluşan atık suları kendi bünyesinde ve kendi bütçesini kullanarak arıtmaktadır. Üniversitemizde 3 (üç) adet kesikli ardışık biyolojik arıtma tesisimiz bulunmaktadır. Toplam atıksu arıtma kapasitemiz 7000 kişi/gündür.
3000 kişi/gün kesikli ardışık biyolojik arıtma tesisi